Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms