Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TRAPPC6BQ86SZ2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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