Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCSAPQ6IQ19 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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