Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF123Q5XPI4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms