Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRCH2Q5VUJ6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms