Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQH8

C6orf136, Uncharacterized protein C6orf136, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136Q5SQH8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C6orf136Q5SQH8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C6orf136Q5SQH8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms