Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM3Q53FZ2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms