Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZC2HC1CQ53FD0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZC2HC1CQ53FD0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZC2HC1CQ53FD0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms