Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms