Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf46Q504U0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms