Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms