Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P3H1Q32P28 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms