Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTN1Q16799 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTN1Q16799 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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RTN1Q16799 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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RTN1Q16799 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTN1Q16799 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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RTN1Q16799 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RTN1Q16799 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RTN1Q16799 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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