Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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NDUFA9Q16795 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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NDUFA9Q16795 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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NDUFA9Q16795 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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