Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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PDK4Q16654 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PDK4Q16654 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PDK4Q16654 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PDK4Q16654 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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