Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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