Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms