Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA6Q16445 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms