Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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