Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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GRIK4Q16099 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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GRIK4Q16099 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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GRIK4Q16099 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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GRIK4Q16099 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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GRIK4Q16099 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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GRIK4Q16099 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK4Q16099 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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