Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TAF1AQ15573 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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