Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF1CQ15572 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF1CQ15572 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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