Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHBQ15464 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHBQ15464 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHBQ15464 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHBQ15464 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms