Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.758e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.737e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.73e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.678e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-209ENST00000463710 757 ntTSL 319.18■□□□□ 0.668e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-212ENST00000471040 848 ntTSL 319.18■□□□□ 0.668e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.638e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 218.96■□□□□ 0.638e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.625e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-218ENST00000492988 854 ntTSL 518.63■□□□□ 0.578e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-221ENST00000552383 1267 ntTSL 218.59■□□□□ 0.578e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.548e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LSS-209ENST00000484808 251 ntTSL 518.42■□□□□ 0.548e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CDT1-202ENST00000562747 735 ntTSL 218.36■□□□□ 0.535e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.529e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 U2AF2-207ENST00000592867 447 ntTSL 218.19■□□□□ 0.55e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.478e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 NDE1-205ENST00000572756 915 ntTSL 517.93■□□□□ 0.468e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-227ENST00000513641 577 ntTSL 517.56■□□□□ 0.43e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.398e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.388e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.365e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-220ENST00000494820 1098 ntTSL 517.29■□□□□ 0.368e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.338e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.328e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-211ENST00000507210 582 ntTSL 317.05■□□□□ 0.323e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.278e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 216.5■□□□□ 0.235e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.228e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 NDE1-203ENST00000570727 588 ntTSL 416.45■□□□□ 0.228e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 316.38■□□□□ 0.215e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TACC3-208ENST00000484264 551 ntTSL 216.34■□□□□ 0.218e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.178e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TRMT2A-208ENST00000459644 582 ntTSL 316.11■□□□□ 0.178e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.169e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.158e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.118e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 MRPS34-203ENST00000569585 713 ntTSL 215.66■□□□□ 0.18e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.098e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.098e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 DGCR8-208ENST00000495351 508 ntTSL 415.64■□□□□ 0.098e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.049e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.038e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.038e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 07e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-220ENST00000509963 432 ntTSL 214.73□□□□□ -0.053e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-209ENST00000546979 554 ntTSL 314.73□□□□□ -0.058e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-215ENST00000508996 348 ntTSL 414.67□□□□□ -0.063e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.079e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.148e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.148e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 COLGALT1-202ENST00000593832 2941 ntTSL 213.93□□□□□ -0.188e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 SSR4-205ENST00000447375 427 ntTSL 213.71□□□□□ -0.218e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.228e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-219ENST00000509664 538 ntTSL 513.7□□□□□ -0.223e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-217ENST00000509164 563 ntTSL 413.52□□□□□ -0.253e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.258e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 213.33□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-228ENST00000514981 653 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-206ENST00000431368 3050 ntTSL 512.9□□□□□ -0.359e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-212ENST00000452656 2763 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.389e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 512.6□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.513e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.529e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.549e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 211.51□□□□□ -0.578e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.629e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.638e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UGCG-204ENST00000490110 581 ntTSL 310.82□□□□□ -0.688e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-209ENST00000548043 4641 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-224ENST00000512236 594 ntTSL 310.39□□□□□ -0.753e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-212ENST00000507546 496 ntTSL 210.37□□□□□ -0.753e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-221ENST00000510824 582 ntTSL 310.37□□□□□ -0.753e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 210.35□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-216ENST00000550958 706 ntTSL 310.18□□□□□ -0.788e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-210ENST00000506801 571 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.793e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.798e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 OCIAD1-225ENST00000512981 1209 ntTSL 410.11□□□□□ -0.793e-20■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 NDE1-207ENST00000573203 762 ntTSL 310.06□□□□□ -0.88e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.817e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.838e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-205ENST00000547226 2642 ntTSL 59.53□□□□□ -0.883e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.918e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.923e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.943e-11■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.958e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.999e-10■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-208ENST00000519991 527 ntTSL 28.6□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-210ENST00000520663 454 ntTSL 38.6□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 10.9
PCBP1Q15365 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.038e-6■□□□□ 10.9
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