Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB35Q15286 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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