Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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