Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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