Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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