Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP1Q13835 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP1Q13835 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP1Q13835 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP1Q13835 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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