Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCOA4Q13772 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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