Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNA1SQ13698 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1SQ13698 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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