Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4BQ13620 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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