Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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