Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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