Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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AP3B2Q13367 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AP3B2Q13367 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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