Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTBP1Q13363 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms