Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 INPPL1-212ENST00000541752 856 ntTSL 218.79■□□□□ 0.66e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.64e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.54e-13■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.54e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.484e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 217.99■□□□□ 0.474e-13■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-13■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.366e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 VTI1A-209ENST00000496445 853 ntTSL 217.3■□□□□ 0.364e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.364e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-EGFL8-203ENST00000428388 2878 ntAPPRIS P5 TSL 217.16■□□□□ 0.344e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.334e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 GTPBP3-216ENST00000598038 2917 ntTSL 517.1■□□□□ 0.334e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.224e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-10■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.174e-10■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.156e-8■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MICALL1-202ENST00000402631 2734 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.124e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-251ENST00000640870 1687 ntTSL 515.79■□□□□ 0.124e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.114e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 515.61■□□□□ 0.096e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 HDAC3-204ENST00000469207 829 ntTSL 315.03■□□□□ -06e-8■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -04e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.014e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MCM3AP-204ENST00000467026 2671 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.024e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 HPS1-212ENST00000480020 795 ntTSL 514.77□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.14e-10■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.194e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 NADSYN1-211ENST00000527963 479 ntTSL 413.82□□□□□ -0.24e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.244e-13■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 HSPA14-203ENST00000441647 578 ntTSL 313.47□□□□□ -0.254e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 513.38□□□□□ -0.274e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-13■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MON1B-207ENST00000566455 2864 ntTSL 213.1□□□□□ -0.314e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 AP2A2-220ENST00000531497 3822 ntTSL 212.56□□□□□ -0.44e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 VTI1A-205ENST00000483122 2423 ntTSL 412.54□□□□□ -0.44e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-247ENST00000640679 1816 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.424e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 VTI1A-204ENST00000480057 598 ntTSL 212.32□□□□□ -0.444e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MCM3AP-207ENST00000486937 4593 ntTSL 212.12□□□□□ -0.474e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MED31-203ENST00000575197 593 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.514e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 511.83□□□□□ -0.524e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.524e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 511.65□□□□□ -0.544e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.584e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 TAF1-210ENST00000467309 1313 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.694e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 MCM3AP-210ENST00000496607 4075 ntTSL 210.73□□□□□ -0.694e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 210.65□□□□□ -0.74e-7■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 PREB-204ENST00000430533 615 ntTSL 210.65□□□□□ -0.74e-10■■■□□ 17.1
PABPC4Q13310 HDAC3-205ENST00000469550 1952 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.726e-8■■■□□ 17.1
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 221.3 ms