Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RESTQ13127 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RESTQ13127 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RESTQ13127 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RESTQ13127 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms