Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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