Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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