Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NPRL3Q12980 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPRL3Q12980 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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NPRL3Q12980 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPRL3Q12980 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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