Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms