Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOS1Q07889 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms