Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DHODHQ02127 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms