Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDR2Q01850 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDR2Q01850 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms