Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms