Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms