Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms