Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKL1Q00532 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms