Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA4Q00056 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms